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FlowJoTM 10是一款强大好用的流式细胞数据分析软件,通过图像分析细胞的各种变化,利用软件自带的分析功能,结合细胞模型创建合理的数据分析平台。

流式细胞技术(flow cytometry,FCM)是利用流式细胞仪进行的一种单细胞定量分析和分选技术。流式细胞术是单克隆抗体及免疫细胞化学技术、激光和电子计算机科学等高度发展及综合利用的高技术产物。流式细胞术工作原理是在细胞分子水平上通过单克隆抗体对单个细胞或其他生物粒子进行多参数、快速的定量分析。它可以高速分析上万个细胞,并能同时从一个细胞中测得多个参数,具有速度快、精度高、准确性好的优点,是当代最先进的细胞定量分析技术之一。

软件功能   

阶梯式设门   

FlowJoTM独特的阶梯式设门试一次革命性的创新。他一改传统复杂的逻辑门设置,将细胞群之间的逻辑关系用简单的递进阶梯式去呈现,并可以自定义细胞群名称、进而直观的现实细胞群统计值,让分析结果一目了然,简单清晰。   

图像呈现法   

多维参数显示   

FlowJoTM提供了灵活的数据呈现方式,全方位满足用户的数据分析需要。它可以呈现一维的直方图,传统的二维图形,及动态立体的三维图形,从多个角度和空间对数据进行360°的静态以及动态解析。   

多种图形类型   

FlowJoTM除了提供传统的散点图,还提供多种图形类型(如密度图,等高图,伪色图,斑马图等),在满足不同分析需求的同时还保证了图像的美观和科学严谨需求。   

多种设门工具   

设门是流失数据分析中界定细胞目标群的必要手段,不管要检测的目标细胞群是规则分布还是不规则分布,小概率事件还是大概率事件,FlowJoTM提供了多种设门工具,从而让用户方便的界定各种细胞群。   

强大的批量处理功能   

用户可以做一个样品的门分析,然后将这个分析批处理应用到其他样品上;也可以做一个样品的图形分析,然后将这个分析批处理用到其他样品上。这样避免了对每一个样品进行重复性试验的分析,即保证了数据分析的一致性及灵活性,同时也极大地提高了分析的效率并且得到完美的分析结果。   

  • 门的批处理   你可以将一个样品的门分析,批量应用到其他的样品上。整个过程只需要轻轻拖动鼠标就可完成,非常简单。   
  • 图形分析的批处理   图像处理也可以用批量分析的方法,将一个样品的分析应用到其他样品上。

多种分析平台及工具   

FlowJo自身包含了多个特殊的分析平台来满足细胞周期,细胞增殖,动力学(钙离子流量)等的分析。这些平台采用权威的已发表的模型算法原理设计,来精确模拟数据分布。FlowJoTM还包含了多种独特的分析工具,如数据联结、衍生参数轴、校准、Backgating、Show Ancestry、Sample Comparision等,让你对数据作进一步的深层分析及处理。   

荧光补偿   

荧光补偿是六十分析里面一个重要的概念也是一个复杂的过程,却是流式分析必不可缺的部分。软件补偿一改过去在机器上手动调节补偿的冗长复杂过程,大大简化了荧光补偿过程,将补偿数据的过程变成一个可理解,可见的简单过程,同时提供了在机器上手动补偿所没有的精确度和灵活性。   

灵活方便的数据导出   

数据的导出在FlowJo里面非常的轻松方便。不管是图形数据还是数据表格,都可以方便的导出成各种格式用来做数据的分享和发表。

软件特色   

  • 省时,批量分析样本;   
  • 分析和自动控制;   
  • 制作信息电影   
  • 研究分子相互作用,可视化化合物优先次序和化合物结构改造   
  • 基于结构的药物设计中,同时考虑多参数的分子结构   
  • 改造的成功率远高于只考虑亲和性的结构   
  • 能将已有的相关参数与实时3D可视化图形相结合

10.8版新功能

  • 提高了大型工作区的计算速度
  • 光谱补偿矩阵归一化与 BD FACSDivaTM软件中的光谱补偿一致
  • 增加了直接打开 .jo 文件的功能
  • 改进了 FlowJo 门户登录

更新

改进的计算速度

上图显示了各种工作区的重新计算时间,这些工作区在样本数量、样本大小和分析复杂性方面各不相同。 我们可以从这个图中得出结论,v10.8 将为大多数数据集提供名义上的性能提升,但是对于更大的数据集,这种提升变得越来越显著,尤其是那些由大量小文件和许多门组成的数据集。

光谱补偿:此时 FlowJo 已将所有补偿矩阵正态化为“对角线”,即主检测器中的值。对于传统的补偿方法,这将始终是最大值,结果对角线将是给定荧光染料信号的 100%。在光谱补偿中,检测器数量和收集参数之间不再存在 1:1 的关系,最大的荧光值可能不在主检测器中。 FlowJo 继续标准化到“主要”检测器并允许更大的数字。 BD FACSDivaTM 中的光谱补偿反而正态化为最大值。重要的是,这两种方法都没有错。荧光值是相对的,所有测量值都将保持相对相同,因此无需重新分析光谱补偿数据。然而,当我们努力在我们控制的所有软件之间更好地对齐时,我们选择对齐两种补偿方法并正态化为最大的数字。这将允许 BD FACSDivaTM 和 FlowJo 用户之间更好的互操作性。

Jo 文件读取:FlowJo 9.x 版生成 .jo 类型文件作为分析输出。 10.8 版将是 10 版的最佳版本,可以直接打开 .jo 文件并将其转换为 .wsp 文件。 对 XML 读取进行了一些调整,以更好地转换组成员身份、对齐时间参数读取以及处理多个同名文件。

改进的 FlowJo 门户登录:现在许可证首选项中有一个‘Show Remember Me’复选框。 选中后,将显示一个复选框,允许用户让 FlowJo 记住他们用于登录的 FlowJo 门户凭据 24 小时。 此外,默认情况下会选中用于身份验证的 HTTPS。

错误修复

  • 隐藏补偿矩阵中的行不再导致编辑偏移问题。
  • 在样本中拖动的布尔门不再参考原始总体。
  • 将偏移直方图叠加导出为 pdf 不再将直方图推离图形
  • 祖先图现在打印为 PDF
  • 将门复制到组不再覆盖修改后的下游门。

 

 

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