Beacon Designer ™

自动化您的实时 PCR 引物和探针设计

当前版本：8.2.1

Beacon Designer^TM 自动设计实时引物和探针。全世界的分子生物学家都使用它来设计成功的实时 PCR 分析。它节省了失败实验所涉及的时间和金钱。Beacon Designer^TM 是一种灵活的解决方案，可满足您的实时引物和探针设计需求，并且节省的费用是成本几倍。正如我们一位尊敬的客户所说：

“我们喜欢你们的程序--它节省了时间，因为我们不必使用 3 或 4 个不同的程序来确定我们设计的探针与其他序列的结合程度。而且它节省了资金，因为我没有购买几个昂贵的标记探针来测试哪一个效果最好。” -乔治亚州亚特兰大免疫莫尔豪斯医学院生物化学部的 Gale Newman 博士

特定且高效的设计：Beacon Designer^TM 如何实现？

您可以从程序中 BLAST 搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中会自动避开表现出显著交叉同源性和模板结构的区域。

可用的设计选项

SYBR® Green 检测设计

SYBR® Green 可能是最常用的实时 PCR 试剂。Beacon Designer^TM 设计 SYBR® Green PCR 引物并帮助您评估预先设计的 SYBR® Green PCR 引物组。您可以完全控制设计参数，也可以使用经过大量研究和与专家沟通后选择的默认值。您甚至可以为您的特定研究需求选择自己的默认设计参数。

除了将引物定位在感兴趣基因的任何位置之外，Beacon Designer 还可以设计跨外显子-外显子或外显子-内含子连接点的引物。这些跨外显子内含子连接设计的引物有助于从 gDNA 中选择性扩增 cDNA。

HRMA 检测设计

Beacon Designer^TM 为突变检测提供全面的解决方案。高分辨率熔解分析 (HRMA) 是一种比基于探针的基因分型分析更具成本效益的方法。该程序采用专有算法，可以设计用于检测突变的最佳引物。

高分辨率熔解分析引物设计在感兴趣的突变两侧，以产生具有可检测熔解温度变化的最短可能扩增子。引物设计避免模板二级结构，确保有效的引物延伸。设计的 HRMA 引物可以在 NCBI 的核苷酸数据库中进行 BLAST 搜索，以检查它们的特异性。也可以分析预先设计或发布的引物。

双标记探针设计

Beacon Designer^TM 目前支持四种基于探针的化学物质：

TaqMan® 探针
- 使用 Beacon Designer^TM 获得最佳 TaqMan® 探针，帮助您使用 TaqMan® SNP 基因分型分析研究差异基因表达或研究 SNP（单核苷酸多态性）。您还可以选择设计越来越流行的锁定核酸(LNA^TM) 替代 TaqMan® 探针，它比标准 TaqMan® 探针更稳定。为了研究DNA 甲基化，Beacon Designer^TM 帮助设计用于 MethyLight 检测的引物和 TaqMan® 探针。甲基光是一种用于区分甲基化和未甲基化 DNA 的高通量检测方法。使用 Beacon Designer^TM，您可以通过为甲基化和未甲基化链以及未处理的 DNA 序列设计寡核苷酸来设计合适的对照引物和探针。使用这些化学试剂中的任何一种，您都可以评估预先设计/已发布的引物或 TaqMan® 探针。设计结果按排名顺序报告，为您提供可供选择的备选方案列表。根据寡核苷酸的性质，指定等级。有关详细信息，请阅读在线帮助中的评级部分。
分子信标
- 设计或评估用于NASBA® 检测的标准分子信标或分子信标。NASBA®是一种引物依赖性技术，可用于在一个温度下连续扩增单一混合物中的核酸。您现在可以为NASBA®分析设计用于单模板或多重反应的分子信标。
Scorpions®
- Beacon Designer^TM 支持 Scorpions® 引物和探针的设计。Scorpions® 分析很重要，因为它们独立于探针的酶切割。引物和探针元件在反应过程中物理耦合。阅读更多关于Scorpions® 技术的信息。
FRET 探头
- Beacon Designer^TM 支持预先设计的 FRET 探头的设计和评估。可以在 Beacon Designer^TM 中设计与预先设计的 SYBR® Green 引物兼容的 FRET 探针。

多重实时 PCR 检测

使用 Beacon Designer^TM，您可以设计基于 TaqMan® 的多重实时 PCR分析，用于多达五个序列，包括参考基因选择。

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系统需求

Windows	需求	推荐
CPU	Pentium IV 1.80 GHz	Intel Core i3 (3rd Gen)
内存	1 GB	2 GB 或更多
硬盘空间	500 MB 可用空间	1 GB 可用空间
屏幕分辨率	800 x 600	1024 x 768

平台支持Windows:XP/Vista/Windows 7/Windows 8/Windows 10

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