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GlycanExplorer™

用于高通量生物治疗性聚糖表征的软件工具

GlycanExplorer 是用于生物治疗性聚糖表征和定量的一站式软件解决方案。借助预加载的高分辨率准确聚糖谱数据库,该软件可让您以无与伦比的信心识别可能的聚糖结构。广泛而全面的数据组织以及交互式图表有助于实现聚糖样品的详细分析,这进一步有助于得出有意义的生物学结论。

工作流

支持工作流

关键特征

HRAM 糖谱库 高效的 LC-MS 峰拾取和对齐
可靠的聚糖鉴定 实时优化
带注释的色谱图和质谱图 全面的结果显示和多糖图谱

GlycanExplorer™工作流

使用 MS1 Spectra 对 N-聚糖进行高通量分析

GlycanExplorer 支持使用 MS1 光谱对衍生和天然(游离还原端)聚糖样品进行 N-聚糖分析。支持的衍生方法是全甲基化和荧光团标记的还原末端修饰。作为先决条件,用户必须创建包含精选 N-聚糖结构的自定义数据库,保存实验信息(如仪器详细信息、电离技术、衍生化、还原末端荧光团),并存储特定结构的 MS1 光谱。

该软件接受实验前体质量、离子种类、还原末端荧光团信息作为输入,并在用户指定的质量容差内使用精确质量搜索报告候选聚糖结构。GlycanExplorer 可在一次搜索运行中识别多个加合物组合的可能聚糖结构,从而节省重复分析所花费的时间。具有最低 delta 质量的聚糖得分最高,并分配给感兴趣的化合物。
数据库搜索完成后,软件会自动生成一个质谱,对已识别的 LC 化合物的每个同位素体进行注释。还可以生成包含已识别聚糖结构的便携式 Microsoft Excel 报告。

主要特征:

1. 高效的 LC-MS 峰检测和选择。
2.详细的数据库搜索参数和过滤器。
3. 一次执行多个加合物组合的数据库搜索。
4. 显示带有注释的 LC 化合物同位素体的 MS1 谱图。
5.便携式Microsoft Excel报告生成。

 

使用 MS/MS Spectra 对 N-聚糖进行高通量分析

GlycanExplorer 可以使用 MS/MS 数据有效识别糖链,用于直接输注、LC-、MALDI-MS/MS 工作流程生成的天然(游离还原端)和衍生糖链样品。支持的衍生化方法是全甲基化和荧光团标记的还原末端修饰,例如 2-氨基苯甲酰胺 (2-AB)、2-氨基苯甲酸 (2-AA)、GlycoWorks Rapi Fluor-MS、普鲁卡因酰胺 (ProcA) 等。该软件接受实验数据并生成候选峰列表(用于 LC-MS 和 MS/MS 数据),进一步进行 MS/MS 数据库搜索以报告候选聚糖结构。可以导出搜索结果以及 Microsoft Excel 文件中的聚糖结构,以便于共享。

该软件适用于三种不同类型的 MS/MS 数据库搜索方法:

  • in-silico片段匹配:在这种搜索方法中,软件通过将实验产物离子与指定目标数据库中可用的聚糖特异性in-silico片段进行匹配来报告候选聚糖结构
  • 谱图匹配:借助内置或自定义创建的高分辨率精确质量 (HRAM) 糖链谱库,该软件允许您通过将实验 MS/MS 谱图与参考谱图进行比较来识别可能的糖链在目标数据库中可用。
  • 计算机片段和光谱模式匹配的组合: GlycanExplorer 引入了一种独特的聚糖结构报告机制,结合了计算机和光谱模式匹配搜索方法的可信度。此工作流程识别候选聚糖,首先通过将实验 MS/MS 片段与聚糖特异性计算机片段匹配,然后将这些实验光谱(报告具有高于指定阈值的计算机分数的聚糖结构)与HRAM 参考光谱库。

主要特征

1. 导入 Thermo Scientific 原生 .raw 文件格式并分配样本和重复。
2. 高效的 LC-MS 峰检测和选择。
3. 用于指定详细数据库搜索参数和过滤器的专用窗口。
4. 可以一次性使用多个加合物组合进行数据库搜索。
5. 显示带注释的 MS/MS 谱图以及糖链结构。
6.便携式Microsoft Excel报告生成。

 

 

 

 

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