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本页列出了当前已知的实际版本问题，以及自第一个版本(5.00)以来修复的问题。请注意，此处报告的问题包括错误(对应于不正确的软件功能)和功能(可能以更有用或更容易使用的方式实现的软件功能)。
如何更新到最新的Canoco版本
要将您当前的Canoco 5安装更新到最新的维护版本，请选择 Help|Check for updates 菜单命令，并按照对话框中显示的说明进行操作。请注意，Canoco经销商提供的用于评估软件的试用版无法更新。
5.15版中修复的问题和增加的改进
- 改进[515-01]:增加了执行蒙特卡罗置换检验（permutation test）的新方法。除了之前置换响应数据的方法(也称为Y置换)，用户现在可以选择置换预测值(X置换)。此外，当使用包含协变量的模型进行测试时，Y排列的算法通过向协变量添加截距得到了适度的改进。仍然存在执行旧类型(“遗留”)Y置换的选项。描述Y-和X-置换的论文在Canoco安装文件夹的pdf子文件夹中，名为“CCA_permutations_draft.pdf”(最相关)和“RDA_permutations.pdf”(更理论化)。
- 改进[515-02]:在双约束排序分析中增加了新的统计摘要。大多数(10)的统计数据是按单个双约束排序轴提供的，但也提供了两个解释变异的调整估计。所有这些新的统计数据都显示在专门的分析笔记本页面(称为双重约束[P]CA ),其中放置了双重置换检验(基于个案和基于响应变量)和可选维度检验的摘要。新的复制按钮允许将大多数显示的信息(旧的和新的)复制到剪贴板上。专业分析笔记本页面也变得可以滚动。
- 改进[515-03]:在双约束排序分析中增加了新型回归双标图，代表CWM(社区加权平均值)对环境预测因子的回归。
- 修复错误[515-04]:在设置双约束排序分析期间，不允许在分析步骤中更改行权重，权重是从前面的步骤转移到这些步骤的。这确保了实施dc-CA或dc-PCA方法的各个步骤的一致性。
- 改进[515-05]:增加了幂变换(指数的默认值为0.1，允许范围为0.01到4)，它既可以应用于成分数据表(通常具有社区成分)，也可以应用于一般数据表中的单个数值变量。
- 功能[515-06]:不再支持在蒙特卡罗置换检验期间对残差进行杠杆校正。
- 修复bug [515-07]:使dc-(P)CA算法在Canoco 5项目中选择响应变量贡献比例时不会产生错误的结果。这在适当的步骤中现在被忽略。
- 改进[515-08]:交互式逐步选择对话框现在在已选择的预测项列表中显示了每个预测项在模型选择阶段被选择时的伪F统计。
- 修正错误[515-09]:用直方图图形化总结蒙特卡洛置换检验结果的窗口在调整大小时不能正确重绘。
- 改进[515-10]:在有限数量的情况下，没有计算所有约束轴。例如，当您的约束(解释)变量形成一个具有9个自由度的模型，并且您的数据集有11个案例时，应该可以计算所有9个受约束的轴(尽管数据集不太适合询问如此复杂的模型)，但Canoco仅估计了前四个。
- 改进[515-11]:扩展了Graph Wizard为双约束排序分析(dc-CA和dc-PCA，包括所有分析模板变量)结果提供的排序图列表，特别添加了CWM分析的回归双标图，该双标图总结了双约束排序中使用的环境预测因子上个体功能性状的社区加权平均值(CWM)的(多重)回归。这些图的描述-由Graph菜单中的“Describe contents”命令提供-也得到了改进。
- 修复bug [515-12]:当修改现有分析(该分析根据稀有物种的出现频率指定排除稀有物种)时，包含个案集的变化不会立即反映在排除物种集中，因此必须完成分析定义，并重新打开和修改设置，以获得正确的结果。
- 修复错误[515-13]:当使用项目|创建派生项目|展开事件创建展开的项目(即“每个案例一个响应变量”)时...菜单命令，完全空的情况下不展开，这在使用线性排序方法分析此类数据时效果不佳。
- 修正错误[515-14]:当创建一个扩展的项目时，最初的空行被赋予权重1.0e-16，而不是精确的零。
- 改进[515-15]:在等值线图中标注等值线时，指定固定小数位数作为首选格式，小数部分的尾随零位数不应删除。
- 改进[515-16]:在等值线图中标注等值线时，避免生成带有负号的零值标注(即“-0.0”之类的标注)。
- 改进[515-17]:当只有一个受约束的轴时，t值双标图的轴的建议固定范围(-1到+1)大部分错过了要在图形中显示的范多本圆的所需范围。因此，在这种情况下，对话框提供并使用(当用户保持选中该框时)范围-1.1到+1.1。
- 改进[515-18]:介绍性文本字段的结尾描述了以下信息的含义，但并不总是可读的，或者在基于“比较约束和非约束排序”或“测试单个约束轴”模板的分析中显示的分析笔记本的专用面板中，该字段跳转到以下字段。
CANOCO 5.12版最新更新
Canoco 5.12 是 Canoco 5.11 的小更新。Canoco 5.12 主要修复了一些错误。它还在物种指标值的计算中增加了对显著性水平的估计。阅读详情。
现有 Canoco 5 用户可以通过帮助|检查更新进行更新。对于新订单，请查看更新和订单。
CANOCO 5.11版最新更新
发表于 2018 年 10 月 29 日
Canoco 5.11 是 Canoco 5.10 的更新，也称为 Canoco 5.1。此更新增加了响应变量（例如物种）对轴和贡献双图的 Canoco 贡献。它还扩展了双标图和三标图的“描述内容”，以帮助对其进行解释和许多其他小的改进。
贡献双图 (Greenacre 2013a,b) 解决了稀有物种看似重要的问题，因为它们通常出现在排序图的边缘，但实际上根本不重要。贡献补充了 Canoco 中的拟合统计数据。
较小的改进包括双约束排序和共同对应分析中的拟合统计数据，以及对自 Canoco 5 手册以来最重要更改的方便概述（请参阅详细信息）。
参考
Greenacre, MJ 2013a。稀有物品在对应分析中的贡献。生态学 94：241-249。http://dx.doi.org/10.1890/11-1730.1
格林纳克，M. 2013b。贡献双图。计算和图形统计杂志 22：107-122。http://dx.doi.org/10.1080/10618600.2012.702494
CANOCO 5.1版最新更新
Canoco 5.1 实现了用于特征环境分析和微生物组数据分析的新方法。现有的 Canoco 5 客户可以使用 Canoco 5 中的常规更新过程更新到 Canoco 5.1。
为微生物组分析设计的新方法是加权对数比 PCA（Greenacre 和 Lewi，2009 年），以及类似的 RDA。新版本中包含了 Canoco 用于微生物组分析的可能性的完整示例。
特征环境分析用于通过社区加权平均值 (CWM) 相关性或第四角相关性进行。这些方法将单个特征与单个环境变量相关联。这些分析现在已完全扩展到多特征多环境变量的情况。新方法允许您检测哪些特征与环境的相关性最高，反之，哪些环境变量与特征的相关性最高。该方法建立了一个回归模型，允许您量化性状、环境和它们的组合解释了多少变异。
新的性状环境方法的基本原理已在一份演示文稿和两篇已发表的论文中进行了总结。第一篇论文链接了基于 GLM 的第四角回归，并扩展了多特征多环境变量案例，即简单双约束对应分析 (dc-CA)。第二篇论文全面描述了 dc-CA 和 Canoco 使用的算法。
Cormont 等人的线性特征环境模型。（2011 年）已扩展到类似于双约束主成分分析（dc-PCA）。
新版本有一个修改后的手册，每个新许可证都附带。免费更新随附 Canoco5/pdf 文件夹中的 pdf，其中包含 Canoco 5.1 中的主要更改（请参阅详细信息）。
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400-621-1085
