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PRIMER

当前版本:7 | 最新更新

PRIMER 大量用于生态学数据的处理,它是一套稳健,广泛适用的多变量数据的统计分析包,特别是物种组合,理化变量,基因,微生物,生物指标,饮食,RS,建模等数据。

PRIMER 7新增学生版授权

对于多变量数据的稳健的,广泛适用的统计分析,例如 物种组成,物理化学变量,遗传,微生物,生物标志物,饮食,RS,建模等数据。

PRIMER 7版本

用于复杂的非参数多变量分析

PRIMER已成为非参数多变量分析软件工具的全球标准。 当变量太多或多变量正态假设不成立时,经典技术就会动摇。

PRIMER采用统计方法来拯救,这些统计方法依赖于强大的排列技术进行严格的推理,通常是根据用户选择的等级相似性进行的。 尽量减少您的假设。 最大化您的见解。

充满了PRIMER独有的一系列新产品(如3因子ANOSIM, 阈值度量MDS,kRCLUSTER,bootstrap平均值等),版本7提供 一个不可或缺的现代工具,用于可视化,分析和表征多变量数据中的显著模式。

Ordination(排序)

用于可视化数据的排序技术,包括主成分分析 (PCA),以及非度量、度量或阈值度量多维缩放(nMDS、mMDS、tmMDS)。

在 2d 或 3d 中可视化高维数据。 自定义文本、颜色和符号。 添加带有叠加层的基本信息,例如集群、轨迹、气泡、图像、矢量或最小生成树。

使用 bootstrapping 在 MDS 图上显示置信区域。 旋转、扩展、旋转、动画、保存和分享您有见地的图像。

生物多样性分析

使用分类、功能和/或系统发育信息为生物多样性评估提供信息。 使用子采样算法针对主列表进行测试。

计算大量经典和新颖的多样性指数或单个变量的汇总统计数据,并使用聚合工具在更高的分类级别分析数据。

为单个变量访问多种灵活的绘图功能:线图、直方图、散点图、条形图、方框图、均值图、曲面图或 Draftsman 图。

特定于生态的工具触手可及,例如优势图、几何类图或丰度生物量曲线 (ABC)。

大量的手册和示例

PRIMER 版本 7 包括特定于上下文的帮助按钮,以及可搜索的 pdf 格式的大量可下载手册:

“海洋社区的变化(第 3 版)”,以非数学术语解释了该软件背后的所有统计方法; 和

“PRIMER v7:用户手册/教程”,准确解释了如何实现这些方法和所有软件实用程序。

软件包中包含大量完整的真实数据集,以便用户可以复制手册和撰写的科学出版物中给出的分析。

 

PRIMER 7        下载试用

 

 


PERMANOVA+插件

根据复杂的研究设计对多变量数据进行建模

PERMANOVA +将基于相似性的分析提升到一个全新的水平:多因素设计,判别分析,模型选择等。

研究人员必须考虑许多同时发生的因素:固定或随机,分层,交叉,平衡或不平衡,重复测量或在时间和空间方面的结构。

PERMANOVA +可让您轻松应对复杂性,包括高阶交互。

使用PERMANOVA +,所有的较难的部分都由专家制定,实施和测试,让您专注于最重要的事情:结果!

PERMANOVA

  • 基于选择的相似矩阵对多元数据进行直接分区。
  • 多因素设计、交互作用、固定或随机因素、嵌套或交叉、不对称。
  • 自动识别给定设计中隐含的所有项,并能够合并或删除项。
  • 基于均方 (EMS) 的预期构建的检验统计量。
  • 置换算法允许多级设计并考虑模型中的其他项。
  • 成对比较和用户指定的对比。
    效应大小/方差分量的估计。
  • 质心之间的距离揭示了阶乘结构中的显著模式。
  • 不平衡或非重复设计(分裂图、随机区组等); 选择SS的类型。

PERMDISP

根据任何相似性度量测试组内多元分散的同质性。

作为 PERMANOVA 的完美补充,PERMDISP 专注于可变性——点在不同组中的“分布”程度。

非常适合研究自然系统中的生态贝塔多样性或遗传变异。

DISTLM / dbRDA

找出一个或多个解释变量解释了多变量数据云中的多少变化。

基于不同的多元多元回归分析在这里完成:

  • 单个回归量的边际和顺序排列测试;
  • 使用向前、向后、逐步或“最佳”方法进行变量选择;
  • 用于模型比较的信息标准(AIC、AICc、BIC、调整后的 R2)的多变量类似物;
  • 分组或单独分析变量集;
  • 使用基于差异的冗余分析 (dbRDA) 排序可视化拟合值。

 

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