PC-ORD 7

当前版本:7 | 最新更新

PC-ORD是一套对输入到电子表格中的生态数据执行多元分析的Windows程序包。软件中的术语是生态学家专用的。我们强调的是非参数工具,图形化的表述,以及用于群落数据分析的随机检验。除了转换数据和管理文件的工具外,PC-ORD 提供了许多在其他主要统计软件包里面不包含的排序和分类技术,包括:CCA,DCA,MRPP,perMANOVA,双向聚类,TWINSPAN, Beals 平滑,多样性指数,物种清单,Mantel测试,许多排序遮盖方法(定量,符号编码,彩色编码,网格,联合策划,双标图,演替矢量(successional vector)),各种旋转方式,三维排序图形,指标物种分析,Bray-Curtis排序,城市街区距离测量,物种区域曲线,树木数据摘要,可出版品质的系统树图,自动导航模式的 NMS。非常大的数据集都可以被分析。

主界面

大部分操作能够接受 32,000 行或者 32,000 列并且最多 536,848,900 个数据的矩阵,只要你的电脑里面有足够的内存。PC-ORD 就是为生态学家量身定做的。完全的手册作为一个上下文相关的帮助系统被包含在软件中。

图形界面

 

PC-ORD规格

 

Advisor Wizard(顾问向导)

导入/导出文件格式

图形

  • 图形类型
  • 图形格式

数据修改

  • 描述性统计和多样性指数
  • 异常值分析
  • Species-area Curves
  • 物种列表
  • 写距离矩阵
  • Shuffle

排序

  • Bray-Curtis (极坐标) 排序
  • 典范对应分析 (CCA)
  • 去趋势对应分析 (DCA, DECORANA)
  • 非度量多维尺度分析 (NMS)
  • NMS 得分
  • 主成分分析 (PCA)
  • 主坐标分析 (PCoA)
  • 互平均 (RA)
  • 冗余分析 (RDA)
  • 加权平均
  • 模糊集 (FSO)
  • 比较得分 (比较排序)

分组

  • 聚类分析
  • 双向聚类分析
  • 多响应排列程序 (MRPP)
  • 区组多响应排列程序 (MRBP)
  • 指示物种分析
  • 区组指示物种分析
  • 指示物种的Phi系数
  • Mantel检验
  • 偏Mantel检验
  • 永久性多变量方差分析 (PerMANOVA)
  • SumF
  • TWINSPAN

图形格式

  • 反射/旋转排序
  • 叠加侧图拟合包络
  • 物种-面积曲线中的置信带
  • PCA 双标向量(计算和绘制基于距离的物种或其他变量的双标)
  • 将图形保存为 emf、wmf、bmp、jpeg、gif 和 tiff
  • 单个图形上的 32 种符号类型或颜色
  • 将图形分辨率设置为 dpi 或屏幕上的视图百分比以进行保存和复制
  • 选择在轴的内部、外部或跨轴放置刻度线
  • 排序点的象限敏感标记(点标签的更智能定位)
  • 双标图、联合图和连续向量上的可选箭头和箭头大小
  • 具有高斯核平滑的侧散点图上的包络

Ordinations

Bray-Curtis (极坐标)

我们提供了超越Bray和Curtis原始方法的众多选项和改进,例如正交轴和方差回归端点选择。

典范对应分析 (CCA)

CCA在PC-ORD的排序方法中是独特的,因为主矩阵的排序(通过互平均)受到第二矩阵中包含的变量的多重回归约束。在群落生态学中,这意味着样本和物种的排序受到它们与环境变量关系的约束。当以下情况时,CCA最可能有用:(1)物种响应是单峰的(驼峰形),以及(2)重要的潜在环境变量已被测量。

去趋势对应分析 (DCA, DECORANA)

DCA是一种基于互平均(RA; Hill 1973)的特征分析排序技术。DCA针对生态数据集,术语基于样本和物种。DCA同时对物种和样本进行排序。

非度量多维尺度分析 (NMS)

非度量多维尺度分析(NMS, MDS, NMDS,或NMMDS)是一种排序方法,非常适合非正态数据或任意、不连续或其他可疑尺度上的数据。NMS通常是群落数据的最佳排序方法。我们的自动导航功能使其易于使用。包含了显著性的蒙特卡罗检验。

 

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7版最新更新

 

Hilltops.jpg (96360 bytes) - 山顶图
山顶图是一种同时显示多个非线性响应面的方法。
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ContourOverlay.jpg (404740 bytes) - 等高线叠加
在任何排序上以等高线表面的形式叠加定量(Q)变量。
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ConvexHullsFilledPolygons.jpg (164154 bytes) - 凸包填充多边形
凸包是一种使用多边形包围组内所有点的叠加层。
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StressByIterationMedium-s.jpg (4756 bytes) - NMS迭代应力

实时显示应力如何随
NMS的每次迭代而变化。
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-

新矩阵格式
分类值现在可以是数值或文本,最多20个字符

新性状窗口和分析
提供了将物种性状数据(性状矩阵)与群落样本(主矩阵)和环境数据(第二矩阵)关联的方法。

新分析

图形增强

软件管理

现有分析的补充

数据管理

逐步指南 v.7

 

 

 

 

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