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PC-ORD 7

当前版本:7 | 最新更新

PC-ORD是一套对输入到电子表格中的生态数据执行多元分析的Windows程序包。软件中的术语是生态学家专用的。我们强调的是非参数工具,图形化的表述,以及用于群落数据分析的随机检验。除了转换数据和管理文件的工具外,PC-ORD 提供了许多在其他主要统计软件包里面不包含的排序和分类技术,包括:CCA,DCA,MRPP,perMANOVA,双向聚类,TWINSPAN, Beals 平滑,多样性指数,物种清单,Mantel测试,许多排序遮盖方法(定量,符号编码,彩色编码,网格,联合策划,双标图,演替矢量(successional vector)),各种旋转方式,三维排序图形,指标物种分析,Bray-Curtis排序,城市街区距离测量,物种区域曲线,树木数据摘要,可出版品质的系统树图,自动导航模式的 NMS。非常大的数据集都可以被分析。

主界面

大部分操作能够接受 32,000 行或者 32,000 列并且最多 536,848,900 个数据的矩阵,只要你的电脑里面有足够的内存。PC-ORD 就是为生态学家量身定做的。完全的手册作为一个上下文相关的帮助系统被包含在软件中。

图形界面

 

PC-ORD规格

 

Advisor Wizard(顾问向导)

导入/导出文件格式

图形

  • 图形类型
  • 图形格式

数据修改

  • 描述性统计和多样性指数
  • 异常值分析
  • Species-area Curves
  • 物种列表
  • 写距离矩阵
  • Shuffle

Ordinations

  • Bray-Curtis (Polar) Ordination
  • Canonical Correspondence Analysis (CCA)
  • Detrended Correspondence Analysis (DCA, DECORANA)
  • Non-metric Multidimensional Scaling (NMS)
  • NMS Scores
  • Principal Components Analysis (PCA)
  • Principal Coordinates Analysis (PCoA)
  • Reciprocal Averaging (RA)
  • Redundancy Analysis (RDA)
  • Weighted Averaging
  • Fuzzy Set (FSO)
  • Compare Scores (Compare Ordinations)

Groups

  • Cluster Analysis
  • Two-way Cluster Analysis
  • Multi-Response Permutation Procedures (MRPP)
  • Blocked Multi-Response Permutation Procedures (MRBP)
  • Indicator Species Analysis
  • Blocked Indicator Species Analysis
  • Phi Coefficient for Indicator Species
  • Mantel Test
  • Partial Mantel Test
  • PerMANOVA
  • SumF
  • TWINSPAN

图形格式

  • 反射/旋转排序
  • 叠加侧图拟合包络
  • 物种-面积曲线中的置信带
  • PCA 双标向量(计算和绘制基于距离的物种或其他变量的双标)
  • 将图形保存为 emf、wmf、bmp、jpeg、gif 和 tiff
  • 单个图形上的 32 种符号类型或颜色
  • 将图形分辨率设置为 dpi 或屏幕上的视图百分比以进行保存和复制
  • 选择在轴的内部、外部或跨轴放置刻度线
  • 排序点的象限敏感标记(点标签的更智能定位)
  • 双标图、联合图和连续向量上的可选箭头和箭头大小
  • 具有高斯核平滑的侧散点图上的包络

Ordinations

Bray-Curtis (Polar)

We offer numerous options and improvements beyond Bray and Curtis' original method, such as perpendicularized axes and variance-regression endpoint selection.

Canonical Correspondence Analysis (CCA)

CCA is unique among the ordination methods in PC-ORD in that the ordination of the main matrix (by reciprocal averaging) is constrained by a multiple regression on variables included in the second matrix. In community ecology, this means that the ordination of samples and species is constrained by their relationships to environmental variables. CCA is most likely to be useful when: (1) species responses are unimodal (hump-shaped), and (2) the important underlying environmental variables have been measured.

Detrended Correspondence Analysis (DCA, DECORANA)

DCA is an eigenanalysis ordination technique based on reciprocal averaging (RA; Hill 1973). DCA is geared to ecological data sets and the terminology is based on samples and species. DCA ordinates both species and samples simultaneously.

Non-metric Multidimensional Scaling (NMS)

Non-metric Multidimensional Scaling (NMS, MDS, NMDS, or NMMDS) is an ordination method that is well suited to data that are nonnormal or are on arbitrary, discontinuous, or otherwise questionable scales. NMS is generally the best ordination method for community data. Our auto-pilot feature makes it easy to use. A Monte Carlo test of significance is included.

 

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7版最新更新

 

- 山顶图
山顶图是一次显示多个非线性响应面的方法。
- 等高线覆盖
在任何排序上叠加一个定量(Q)变量作为轮廓曲面。
- 凸包填充多边形
凸包是使用多边形包围组中所有点的覆盖。
- NMS迭代压力
实时显示压力如何随着NMS的每次迭代而变化。

- 新的矩阵格式
类别值现在可以是数字或最多20个字符的文本

新特性窗口和分析
提供将物种特征数据(特征矩阵)与群落样本(主矩阵)和环境数据(第二矩阵)相关联的方法。

新的分析

图形增强

软件管理

对现有分析的补充

数据管理

逐步指南v.7
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