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CANOCO 5.12版最新更新

Canoco 5.12 是 Canoco 5.11 的小更新。Canoco 5.12 主要修复了一些错误。它还在物种指标值的计算中增加了对显著性水平的估计。阅读详情。

现有 Canoco 5 用户可以通过帮助|检查更新进行更新。对于新订单,请查看更新和订单。

CANOCO 5.11版最新更新

发表于 2018 年 10 月 29 日

Canoco 5.11 是 Canoco 5.10 的更新,也称为 Canoco 5.1。此更新增加了响应变量(例如物种)对轴和贡献双图的 Canoco 贡献。它还扩展了双标图和三标图的“描述内容”,以帮助对其进行解释和许多其他小的改进。

贡献双图 (Greenacre 2013a,b) 解决了稀有物种看似重要的问题,因为它们通常出现在排序图的边缘,但实际上根本不重要。贡献补充了 Canoco 中的拟合统计数据。

较小的改进包括双约束排序和共同对应分析中的拟合统计数据,以及对自 Canoco 5 手册以来最重要更改的方便概述(请参阅详细信息)。

参考
Greenacre, MJ 2013a。稀有物品在对应分析中的贡献。生态学 94:241-249。http://dx.doi.org/10.1890/11-1730.1

格林纳克,M. 2013b。贡献双图。计算和图形统计杂志 22:107-122。http://dx.doi.org/10.1080/10618600.2012.702494

CANOCO 5.1版最新更新

Canoco 5.1 实现了用于特征环境分析和微生物组数据分析的新方法。现有的 Canoco 5 客户可以使用 Canoco 5 中的常规更新过程更新到 Canoco 5.1。

为微生物组分析设计的新方法是加权对数比 PCA(Greenacre 和 Lewi,2009 年),以及类似的 RDA。新版本中包含了 Canoco 用于微生物组分析的可能性的完整示例。

特征环境分析用于通过社区加权平均值 (CWM) 相关性或第四角相关性进行。这些方法将单个特征与单个环境变量相关联。这些分析现在已完全扩展到多特征多环境变量的情况。新方法允许您检测哪些特征与环境的相关性最高,反之,哪些环境变量与特征的相关性最高。该方法建立了一个回归模型,允许您量化性状、环境和它们的组合解释了多少变异。

新的性状环境方法的基本原理已在一份演示文稿和两篇已发表的论文中进行了总结。第一篇论文链接了基于 GLM 的第四角回归,并扩展了多特征多环境变量案例,即简单双约束对应分析 (dc-CA)。第二篇论文全面描述了 dc-CA 和 Canoco 使用的算法。

Cormont 等人的线性特征环境模型。(2011 年)已扩展到类似于双约束主成分分析(dc-PCA)。

新版本有一个修改后的手册,每个新许可证都附带。免费更新随附 Canoco5/pdf 文件夹中的 pdf,其中包含 Canoco 5.1 中的主要更改(请参阅详细信息)。

 

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综述
最新更新:5.12
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