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Geneious Prime 2026.0 版本发布说明
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版本 2026.0（2025 年 11 月 18 日）
补丁版本：2026.0.2
测试版（2026.0.0）于 2025 年 10 月 28 日发布
新功能：
- 一步多插入点 Golden Gate 克隆，支持将非连续片段插入到载体骨架中（仅企业版）
- 在 Golden Gate 克隆对话框中添加了多插入点选项卡
- 重构了 Golden Gate 克隆用户界面，提供更自然的操作流程
- 在序列视图中显示被酶切的完整环形骨架序列中突出显示的骨架片段区域
- 增强的多插入点 Gibson 和 In-Fusion 克隆（仅企业版）
- 现在支持谱系，可链接回各个骨架片段
- 来自环形骨架的来源在结果构建体中得以保留
- 在单插入点和多插入点之间切换时，会记住选择的酶切和其他文档
- 改进了用户界面布局和对调整大小的响应
- 增强了组装报告，包含关于骨架酶切的信息
- 在本地数据库上方添加了新的收藏夹部分，便于快速访问常用文件夹
- 可以将本地或云工作区中的文件夹添加到个人收藏夹部分
- 收藏夹部分中显示文件夹中的文档，子文件夹不会显示在收藏夹面板中
- 通过右键菜单可跳转到本地或云工作区中的文件夹位置
- 收藏夹中显示的文件夹颜色与本地或云工作区中的文件夹颜色同步
- 导入文件时，收藏夹文件夹显示在文档选择器的顶部
- 支持从使用 SnapGene 克隆模拟创建的 *.dna 文件导入第一级历史记录
- 现在将历史记录颜色作为片段注释导入，用于通过 SnapGene 克隆模拟创建的序列
- 现在导入通过 SnapGene 克隆模拟创建的构建体的直接父序列，并记录在谱系中
- 可以从谱系选项卡和片段注释工具提示中的源链接恢复父文档
- 用于产生构建体的克隆反应中使用的引物和酶记录在片段注释中
- Dotmatics Luma 集成
- 克隆工具现在可以根据 Luma 蛋白质设计自动组合正确的区域组合
- Luma 抗体区域数据库已重命名为序列集
- 现在可以在序列集或类型特定的数据库中搜索骨架、构建体和插入片段
- 发送构建体和骨架到 Luma 时现在包含遗传密码表
- 部件和预测翻译现在添加了遗传密码 ID，以链接到 Luma 中的遗传密码表。如未指定，遗传密码将设置为通用
- 支持发送使用多插入点 Gibson 或 Golden Gate 克隆创建的构建体到 Luma
- 现在向 Luma 发送所有克隆的克隆验证数据
次要功能和改进：
- 文档历史记录
- 现在尽可能显示用户的 Geneious 账户全名，而不是其操作系统用户名
- 对云工作区中文档的修改现在能更快速地响应其他用户或机器的更改
- 提高了在云工作区保存文档历史的可靠性
- 添加了极紧凑密度主题，其表格间距与 Geneious Prime 2025.0 及更早版本相似
- 云管理：
- 添加了基于浏览器的云工作区导出下载支持
- 改进了工作区导出的文件名和数据结构
- 调整了审计日志消息以提高清晰度
- 现在支持导出所有存储的审计日志行（之前为 10,000 行）
- 现在支持在用户停用时转移共享的云工作流
- 云工作区：
- 显著改善了在文件夹之间移动多个云文档时的性能
- 改进了计算 Geneious 云文件夹大小的性能
- macOS 标题栏在深色模式主题下现在为深色
- 改进了从共享数据库批量移动多个文档时的进度消息
- 新创建的发布文档现在与所有旧版本的 Geneious 兼容
修复和次要更改：
- Golden Gate：现在不允许在包含所选酶单一切割位点的序列上设计引物
- 修复了当骨架被限制性内切酶酶切时，由于缺少文档链接导致的 Gibson/In-Fusion 克隆谱系和选项历史记录问题
- 修复了 Gibson 和 In-Fusion 克隆中来自酶切骨架的数字来源未被保留的问题
- 序列视图：修复了超出序列末端的引物扩展显示截断的问题
- 组装：修复了当参考序列或 reads 具有非常长的文档名称时某些组装选项不显示的问题
- 改进了引物扩展对话框的用户界面，包括标签更新、标签颜色一致性以及移除不必要的列
- 导入：修复了导入 zip 文件后进度窗口仍然可见的问题
- 改进了关于 Geneious 对话框中显示的许可证信息
- 改进了在克隆中使用多区间 Gibson 引物扩展注释时的错误消息
- 参考序列比对：修复了使用"查找结构变体、短插入和任何大小的缺失"设置时的罕见崩溃问题
- 云工作区：
- 改进了用户界面，以指示许可证到期后工作区处于只读模式
- 改进了在云文档上运行 MUSCLE 比对时的进度对话框
- 改进了处理文件夹名称冲突的一致性
- 改进了无法访问服务器时的错误处理
- 修复了注销后直接重新登录同一工作区时的一些罕见崩溃
- 修复了导致云中存储的工作流显示在错误部分的轻微 bug
- 删除大型文件夹时显示状态消息
- 修复了当工作区根文件夹下存在名为"已删除项目"的文件夹时云插件会崩溃的 bug
- 修复了登录后立即注销时的崩溃问题
- 修复了将云文档移动到已删除项目时偶尔发生的崩溃
- 修复了打开首选项时偶尔发生的崩溃
- 修复了导致 Geneious Prime 偶尔冻结的 bug
- 修复了加载缓存文档时偶尔发生的崩溃
- 修复了将工作流保存到云时偶尔发生的崩溃
- 修复了测试版中两个已删除文件夹同名时发生的崩溃
- 修复了加载自定义注释类型时可能发生的罕见崩溃
- 修复了注销云后可能发生的崩溃
- 统一了将不同来源的文档从已删除项目拖出时的行为
- 优化了云中不同文件夹之间移动文档的性能
- 云和共享数据库：修复了加载文档时有时会出现的界面锁定问题
- 修复了从共享数据库删除具有谱系的文档时可能发生的崩溃
- 修复了阻止通过命令行界面运行 Golden Gate 克隆的 bug
- 修复了查看先前克隆运行选项时可能发生的罕见崩溃
- 修复了在 Gibson 克隆中使用大型序列时的罕见崩溃
- 修复了有时在之前通过酶切片段工具酶切的文档上执行克隆操作时发生的崩溃
- 修复了快速连续删除和恢复云工作区上存储的文档可能不会显示已恢复的 bug
- 修复了克隆中"按结果分组"选项的视觉 bug
- 改进了导出 FASTA 文件时的错误消息
- 修复了具有序列列表中文档的克隆反应未正确执行的 bug
- 修复了 Golden Gate 不遵守所选 PCR 引物注释的 bug
- 修复了在多区间注释上运行查找 CRISPR 位点有时会在目标序列的错误位置添加 CRISPR 注释的 bug
- 修复了导致激活对话框在许可证可以激活前就消失的问题
- 修复了测试版中可能导致同时删除多个文件夹和子文件夹时崩溃并产生不一致结果的 bug
- 修复了加载 Sassafras 本地库的问题
- 修复了由于在 macOS 上无法获取正确的主要 MAC 地址进行机器识别而导致的许可证问题
- 修复了测试版中在 macOS 上选择文档时性能不佳的问题
其他说明：
- 更新了自定义 Blast 至 v2.17.0
- 许可证管理：
- 添加了使用机器访问令牌激活 Geneious Prime 的支持
- 添加了通过外部浏览器应用程序使用电子邮件登录激活 Geneious Prime 的支持
- 修复了阻止新用户在桌面版激活许可证前登录 Geneious 云管理控制台的问题
- 添加了将用户从多用户云工作区自动转移到另一个工作区的支持（不转移文档）
- 如果用户的授权被撤销然后重新授予，自动重新激活用户的云账户
- 改进了云工作区状态更改时的通知邮件
补丁版本 2026.0.2（2025 年 12 月 9 日）
修复和次要更改：
- 改进了在 macOS 上使用 Safari 通过外部浏览器进行许可证激活
- 克隆：修复了阻止某些克隆操作通过 Windows CLI 运行的 bug
- Geneious 服务器数据库：更新了 Tomcat 服务器版本至 9.0.112
- Dotmatics Luma：
- 更新了序列集的搜索查询，以支持独立的蛋白质和核酸物质类型
- 修复了上传具有相同 Set ID 的多个文档会创建重复 Set 的问题
- 修复了骨架片段上的引物未正确发送到 Luma 的问题
- 云工作区：修复了在云工作区上传或访问许多文档后可能发生的崩溃
- 设置配对 reads：修复了当按序列名称配对时，在某些序列名称格式下可能错误配对 reads 的 bug
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