|
|
UCSF ChimeraX一个可扩展的分子建模系统
当前版本：1.11
UCSF Chimera 是一个用于分子结构和相关数据（包括密度图、轨迹和序列比对）的交互式可视化和分析的程序。 它可免费用于非商业用途。 商业用户，请参阅 Chimera 商业许可。 我们鼓励 Chimera 用户尝试使用 ChimeraX 以获得更好的大型结构性能，以及其他主要优势和全新功能。 ChimeraX 包括 Chimera 功能的一个重要子集（更多功能，请参阅缺失的功能列表）并且正在积极开发中。 用户可以选择同时使用这两个程序，两个都安装也可以。 Chimera 不再处于积极开发阶段，仅针对关键维护进行更新。 Chimera 的开发得到了美国国立卫生研究院 (P41-GM103311) 的资助，该资助于 2018 年结束。 功能亮点Matchmaker叠加 Matchmaker 工具（或 matchmaker 命令）便于叠加相关结构，而无需担心编号或遗漏残基。 它通过创建成对序列比对来叠加蛋白质或核酸，然后在 3D 中匹配序列比对的残基。 二级结构有助于指导序列比对，从而在具有更难比对序列的更远亲的蛋白质上获得更好的性能。 默认情况下，拟合被迭代以排除结构上不同的区域并更紧密地叠加最相似的部分。 可以显示结果序列比对，如本示例中的三种果胶酸裂解酶：PDB 1jta、1bn8 和 2pec（请参阅命令文件 peclyases.cxc）。 在序列比对中，最终拟合迭代中使用的残基包含在浅橙色框中。 RMSD 值和其他拟合统计数据在日志中报告。
B因子着色 原子 B 因子值从 PDB 和 mmCIF 输入文件中读取，并指定为可以用颜色显示并用于原子规范的属性。 此示例显示与抑制剂 (PDB 4hvp) 结合的 HIV-1 蛋白酶结构内的 B 因子变异。 有关完整的图像设置，包括定位、颜色键和标签，请参阅命令文件 bfactor.cxc。 其他颜色键示例可以在教程中找到：通过静电势着色、通过序列守恒着色
UCSF ChimeraX 优势相对于 Chimera，ChimeraX 提供了几个优势，并且这个列表将继续增长。 下面给出了一个小样本。 另请参阅：功能亮点、示例图片
在线留言尊敬的客户朋友，如您有任何意见建议，请通过下表反馈给我们，我们会尽快与您联系。
|
|
|
||||||||||||||||||||||||
400-621-1085
