SimMet®
用于质谱代谢物数据分析的综合软件套件,可促进 LC-MS 数据处理、代谢物鉴定、定量和统计分析
SimMet 处理 LC-MS 数据以进行峰检测、峰拾取和保留时间校准。它使用户能够在批处理模式下使用 MS 和 MS/MS 数据识别代谢物。除了对已鉴定的代谢物进行定量数据分析外,它还有助于对生物样品中的代谢物进行差异分析。
强大的关系代谢物数据库
SimMet 数据库包括来自人类、大肠杆菌等各种生物来源的 68,459 种代谢物。并支持来自 NIST MS/MS 数据库的 9,390 种代谢物的 2,34,284 个 MS/MS 谱图和 354 个加合物。其他生物信息,如代谢物通用名称、系统名称、质量、组成和与其他数据库的链接,也可供参考。
SimMet®通过将观察到的 MS/MS 谱图与代谢物的标准 MS/MS 谱图进行匹配,提供代谢物的准确鉴定。
支持多种文件格式
SimMet®接受标准文件格式的实验质谱数据,例如 .txt、.xls、.mzData 和 .mzXML。它可以读取 Thermo Scientific (*.raw) 和 SCIEX (*.wiff) 以及 Bruker Corporation 的(.baf、.yep 和 .fid)原生数据文件。该程序能够从完整的色谱运行(即多达 200,000 次扫描)中导入数据。
协议概述
SimMet®处理 LC-MS 数据以进行峰检测、峰拾取和保留时间校准。它使用户能够在批处理模式下使用 MS 和 MS/MS 数据识别代谢物。它可以对已识别的代谢物进行定量数据分析,以及对生物样品中的代谢物进行差异分析。
为您的所有分析提供单一平台
SimMet 的综合平台无需管理和使用多种代谢物研究工具。所有代谢物数据分析,从 LC-MS 数据处理和随后的峰识别到统计分析(如主成分分析)都可在单个工作区中进行。支持加载和得分图以及置信椭圆(相关加载和 Hotelling 的 T 2椭圆),以帮助研究人员了解代谢物和样品之间的关系。还提供了代谢物响应曲线以显示不同样品中代谢物丰度的变化。
轻松管理大数据
SimMet®旨在有效处理大量数据,这是基于质谱的代谢组学工作流程的典型特征。用户可以在单个项目中加载 50 万次扫描,以及一次导出 50,000 次扫描的分析结果。支持所有标准供应商格式,以无缝集成定性和定量工作流程解决方案。
升级
SimMet® 2.42 发布
新版本包括:
- 支持 SCIEX 的 .t2d 文件: SimMet 现在支持从 SCIEX TOF/TOF 质谱仪加载 .t2d 文件。
- 改进了 Shimadzu (QTOF) 本机数据文件的加载: SimMet 现在可容纳 Shimadzu Corporation 提供的最新数据读取算法。这显着提高了岛津 QTOF 仪器系列软件的数据加载能力。
SimMet® 2.40 发布
新版本包括:
- 改进的 LC-MS 峰选取算法:现在实施了一种用于检测 LC 峰以及随后从原始数据中查找分子特征的有效算法。改进的算法可以准确地检测 LC 化合物及其同位素包络线,使程序能够准确地为 MS/MS 扫描分配母离子 m/z 值。
- 使用包含列表的高效数据减少技术:您可以为 SimMet 创建一个包含质量列表以执行峰检测,从而消除可能是噪声的峰。
- Shimadzu 的 QTOF 数据: SimMet 现在支持分析由 Shimadzu 的 LCMS-9030 四极杆飞行时间 (QTOF) 质谱仪生成的 QTOF 数据。该软件直接从岛津的原生 .lcd 文件格式读取原始数据。
SimMet® 2.30 发布
SimMet 现在支持以下功能:
- SimMet 数据库现在可容纳来自各种生物来源(如人类、大肠杆菌)的 68,459 种代谢物。
SimMet® 2.20 发布
SimMet 现在支持以下功能:
- 组织良好的报告,包括 CAS 登记号、P 值和最大值。倍数变化,以提供有关主要代谢物的更深入信息。
- 修复报告的问题。
SimMet® 2.10 发布
新版本包括以下增强功能:
SimMet 现在采用了改进的峰值拾取和峰值检测算法,可以更快地处理 LC-MS 和 MS/MS 数据。新的专有算法使程序能够对任何原始数据文件执行峰检测和分子特征查找,速度至少比以前版本的程序快 3 倍,同时确保不会遗漏重要的化合物及其分子特征。
系统需求
对于 Windows |
必需的 |
推荐的 |
中央处理器 |
酷睿 i3 |
更高 |
内存 |
8 GB 可用 RAM |
更高 |
硬盘空间 |
100 GB 可用硬盘 |
更高 |
屏幕分辨率 |
1024x786 |
>1024 x 768 |
Windows 支持的平台:Vista/Windows 7/Windows 8/Windows 10
相关视频
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