ChromasPro

 

当前版本:2.2.0  | 最新更新

 

ChromasPro是一款好用的DNA测序图谱软件,软件主要适用于专业的生物学人员使用,软件适用于测序的项目可以高达几百万碱基,并拥有实用的基本序列编辑、序列分析、生成限制位点和片段图以及搜索序列等多种功能,是您进行专业研究的好帮手。

ChromasPro功能

  • 以应用生物系统、Staden色谱图(SCF)、MegaBace (esd)、FASTA、EMBL、GenBank、SwissProt,、GenPept、GCG RSF和纯文本格式打开和保存序列。

  • 将重叠序列组装一致,自动显示含糊不清的序列并编辑。
  • 用高质量数据自动消除低质量序列并提高序列集合。
  • 查看检测基因型文件。
  • 生成限制位点和片段图,并且列举切割、无切割和片段。
  • 染色体图开放阅读框,借助G+C框架图,点击一下即可翻译ORFs。
  • 打印色谱图,限制位点和片段图,并且打开阅读框架图。
  • 执行核苷和蛋白质BLAST,通过NCBI网站搜索。
  • 通过ClustalW的界面执行多序列。
  • 逆向&补充序列和色谱图。
  • 通过准确匹配或最佳队列搜索序列。
  • 当编辑核苷酸系列时显示翻译。
  • 执行反向翻译和标出核苷酸退化。
  • 划分蛋白质的亲水性和抗原性。
  • 复制色谱图截面的图形粘贴到文档或演示文件中。

自1996年流行的Chromas程序首次发布以来,Technelysium一直提供DNA测序和分析软件。我们的软件适用于不需要花费数千美元的大型软件包的项目。我们有两款产品:

Chromas是一款免费、简单、易用的查看器和编辑工具,用于用于自动Sanger测序器的色图(迹迹)。它拥有多种格式转换选项,包括批量处理功能,可同时处理大量文件。从2.6版本开始,它可以使用PeakTrace RP来增强.ab1文件并提取更多高质量的碱基(这是一项付费服务)。

ChromasPro 用于将序列读段组装成 contig,并配有图形化 contig 编辑器,显示对齐色谱图。它还支持一般序列分析,如限制酶定位、开放读取帧搜索和BLAST提交。

ChromasPro适用于DNA序列组装项目,最高可达几兆碱基,以及基础的序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器如ABI以及454和Illumina下一代序列器中汇编数据,如果有8GB内存,最多可处理1,000,000条序列。ChromasPro 具备以下功能:

  • 应用生物系统.ab1、斯塔登色谱图(SCF和ZTR)、454 SFF、FASTA、FASTQ、EMBL、GenBank、SwissProt、GenPept、GCG RSF及纯文本格式中的开放序列。
  • 保存序列格式为.ab1、.scf、.fasta和.fastq格式。
  • 通过图形界面组装重叠序列,达成共识并突出歧义以便编辑。
  • 利用质量数据自动去除低质量序列,以提升序列组装。
  • 用参考序列作为组装的支架。
  • 生成限制位点和片段图,列出切割器、非切割者和片段。
  • 借助G+C帧图绘制开放阅读框,一键翻译ORF。
  • 打印色谱图、限制位点和片段图谱,以及开放式阅读框图谱。
  • 通过NCBI网站进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
  • 通过与ClustalW接口进行多次对齐。
  • 逆序与补集序列以及色谱图。
  • 通过精确匹配或最优比对来搜索序列。
  • 编辑核苷酸序列时显示翻译结果。
  • 进行反向翻译并绘制核苷酸简并图。
  • 绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
  • 复制色谱图剖面的图像,用于粘贴到文档或演示文稿中。

兼容Windows 7sp1, 8, 10, 11。

您的免费试用期为14天。请参见购买页面以获取授权信息。

持证用户可免费升级至旧版本。

请注意:ChromasPro 2 将与 1.9.9 之前的版本单独安装。建议你卸载所有旧版本。请参阅版本历史以了解最新版本的更改。

 



 

 


 

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