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功能特征新改进的搜索算法
自动序列检索 使用登录号/GI 编号和检测 ID，将批量序列直接从 GenBank 和 dbSNP 快速检索到程序中。 使用多重检索工具，可以从本地驱动器加载序列。 自动同源和模板结构避免引物特异性可以通过执行 BLAST 搜索和从程序中搜索模板结构来实现。 在设计引物时使用这两种搜索的结果。 在引物设计过程中会自动避开表现出显着交叉同源性和模板结构的区域。 评估预先设计的引物Primer Premier 分析和评估预先设计的引物的特性并对其进行排名，以判断引物与所需目标值的距离。 如果您正在使用已发布或预先设计的经过充分验证的引物，则此功能特别有用。 也可以评估多达 5 个错配的引物。 对于特定的引物，Primer Premier 甚至可以设计兼容的套装。 例如，对于预先设计或发布的正向引物，Primer Premier 可以找到符合所有设计标准的兼容反向引物。 您甚至无需输入模板序列即可评估正向/反向引物或引物对。 Primer Premier 显示正在分析的寡核苷酸的所有属性，并以 HTML 或 csv 文件格式导出它们。 对引物进行排名，使您能够判断它们与目标值的接近程度。 手动引物搜索Primer Premier 在用户手中提供对引物设计的完全控制。 使用手动引物搜索选项，用户可以单击模板序列上的任何核苷酸以在他们选择的位置获取引物。 Primer Premier 设计了一个引物，其 3' 末端位于该核苷酸处，并立即分析其特性。 根据用户的方便，引物的长度也可以增加/减少。 对于诱变和克隆，此功能有助于在其他受限区域中获得最佳设计。 Primer Premier 能够沿着 DNA 序列“滑动”引物序列，实时显示特性，使用户能够可视化定位寡核苷酸的最佳位置。 编辑模板序列模板序列可以编辑。 可以使用标准的剪切/复制/粘贴功能修改基地，在感兴趣的位置归零。 可以通过选择它们并单击删除来删除不需要的序列区域。 该程序还允许用户为序列添加注释或注释以供将来参考。 序列视图可以以每块 3 或 10 个碱基、单链或双链的方式查看所选序列。 标记设计的引物，蓝色为有义引物，红色为反义引物。 选定的 SNP 以粉红色标记。 同源区域用黄色突出显示，参与模板结构的碱基用下划线表示。 您可以导出“序列视图”以及 csv 或 HTML 格式的引物设计结果。 生成报告您可以为您为实验室笔记本设计的检测创建演示质量报告，并与同事共享信息。 该报告将引物在序列上的位置可视化，包括替代引物列表，显示引物、扩增子和序列属性以及引物设计程序使用的设计参数. 本地和桌面 BLAST 选项您可以使用本地和桌面 BLAST 选项针对本地自定义数据库对您的序列进行 BLAST。 在您的计算机上创建文本或 FASTA 格式的序列数据库，并从 Primer Premier BLAST 您的查询序列。 然后将结果用于引物设计。 如果您不想在 Internet 上提交数据或处理未公开的信息，则此支持特别有用. 计算器内置计算器可计算 GC%、显示碱基计数并使您能够获得互补链和反向互补链。 数据和数据库管理可以创建多个项目。 通过为每个实验创建单独的项目，可以轻松管理多个实验的数据。 维护用于序列信息和搜索结果的本地数据库。
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