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PRIMER尽量减少您的假设。 最大化您的见解。当前版本：7 | 最新更新
全球数以千计的研究人员信赖PRIMER在多变量分析中的独创性和清晰度。 分析生态数据或任何其他数据 可从安全的非参数方法中受益。 PRIMER v7提供了广泛的单变量，图形和多变量程序，用于分析来自社区生态学的逐个样本数据。 数据通常包括丰富的生物量，面积（或线）覆盖率，存在/不存在等，并且在环境影响的生物监测和更基础的生态研究中出现。还照顾了物理值和化学浓度的矩阵，其本身或与生物组合数据并行分析，例如，以检查生物变化与物理化学条件的共同变化。 尽管生物组合数据的分析要求是一个主要焦点，但该方案同样适用于（并且越来越多地应用于）多变量或可以如此对待的其他数据结构。 统一特征是所有数据集都可以简化为适当的三角矩阵，表示每对样本的组合，包括它们的组合，生物标记套件，粒度分布，生长曲线的形状等。聚类和排序技术是然后能够显示样本之间的关系，并使用排列测试来检验假设。 轻松处理数据和结果PRIMER 工作区 (*.pwk)
Ordination（排序）用于可视化数据的排序技术，包括主成分分析 (PCA)，以及非度量、度量或阈值度量多维缩放（nMDS、mMDS、tmMDS）。 在 2d 或 3d 中可视化高维数据。 自定义文本、颜色和符号。 添加带有叠加层的基本信息，例如集群、轨迹、气泡、图像、矢量或最小生成树。 使用 bootstrapping 在 MDS 图上显示置信区域。 旋转、扩展、旋转、动画、保存和分享您有见地的图像。 聚类使用单个、完整、组平均或灵活的 beta 链接选项将层次聚类到样本（或变量/物种）组中。 创建 cophenetic 距离矩阵并绘制树状图。 在多个页面上自定义、旋转、折叠、放大或打印它们以捕捉所有更精细的细节。 相似性配置文件 (SIMPROF) 和相关的排列测试确定样本或物种组的一致性。 分裂聚类方法可以不受约束（UNCTREE），也可以受环境（或其他）变量约束（LINKTREE），而 krCLUSTER 执行 k 均值聚类的非参数版本。
阴影图和热图显示 2d 或 3d 中的实际值，可选择灰度或彩色光谱。 显着的模式很容易被发现。 可以根据各种标准对样本和变量进行排序，包括梯度、聚类约束或分组。 标签和符号很容易修改和定制。
非参数检验使用相似性分析 (ANOSIM) 的基于排列的假设检验，它检验来自不同时间、地点、实验处理等的多变量样本组之间的差异。 PRIMER 的算法现在支持这些完全非参数检验的大多数三向设计。 识别主要提供两组样本之间的区分的物种 (SIMPER)。 测试序列和其他 Mantel 类型的时间或空间序列数据测试。 将矩阵相互关联或确定变量子集，这些子集共同产生与给定相似矩阵的“最佳”Mantel 类型匹配。 置换测试包括变量选择步骤，以确保严格的统计推断。
生物多样性分析使用分类、功能和/或系统发育信息为生物多样性评估提供信息。 使用子采样算法针对主列表进行测试。 计算大量经典和新颖的多样性指数或单个变量的汇总统计数据，并使用聚合工具在更高的分类级别分析数据。 为单个变量访问多种灵活的绘图功能：线图、直方图、散点图、条形图、方框图、均值图、曲面图或 Draftsman 图。 特定于生态的工具触手可及，例如优势图、几何类图或丰度生物量曲线 (ABC)。
大量的手册和示例PRIMER 版本 7 包括特定于上下文的帮助按钮，以及可搜索的 pdf 格式的大量可下载手册： “海洋社区的变化（第 3 版）”，以非数学术语解释了该软件背后的所有统计方法； 和 “PRIMER v7：用户手册/教程”，准确解释了如何实现这些方法和所有软件实用程序。 软件包中包含大量完整的真实数据集，以便用户可以复制手册和撰写的科学出版物中给出的分析。
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