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Stata提供哪些Meta分析功能?

标题 用户编写的用于在Stata执行meta分析的包
作者 Jonathan A. C. Sterne, University of Bristol
Ross J. Harris, University of Bristol
Roger M. Harbord, University of Bristol
Thomas J. Steichen, RJRT
日期 2007年1月; 2011年7月更新

Stata本身没有Meta分析命令。然而Stata用户开发了一套优秀的命令来执行Meta分析。

在2009年,Stata出版了Meta-Analysis in Stata: An Updated Collection from the Stata Journal,汇集了Stata杂志中所有的Meta分析的文章。这本书可以从下列地址购买http://www.stata-press.com/books/mais.html

我们创建了一个命令来下载在书中讨论的所有用户编写的命令。有关获得命令的说明,请参阅http://www.stata-press.com/data/mais.html。?

以下Meta分析的命令都在Meta-Analysis in Stata: An Updated Collection from the Stata Journal中描述过。

1.metan

metan是主要的Stata Meta分析命令。它的最新版本允许用户为每个研究的2×2表格输入单元格频数(适用二元输出),或每个组的均值和标准差(适用数值输出),或每个研究的效应估计值和标准误。它提供了一个全方位的Meta分析方法,包括逆方差加权Meta分析,和创建含每个研究的治疗效应估计值和标准误的新变量。然后这些变量可以被用作为输入或新的Stata Meta分析命令。Meta分析可以通过使用by()选项在亚组中执行。

metan中的所有Meta分析计算都是基于标准方法,综述可以在Deeks, Altman, and Bradburn (2001)的第15章中找到。

在Stata 7图形中使用的metan命令的版本已经被命名为metan7,可以从SSC归档中下载到部分metan包。

最新的metan帮助文件提供几个可点击的关于如何使用命令的示例。

2. labbe

labbe为事件数据画出一个L’Abbe图(在2个组中的成功的比例)

3. metacum

metacum执行累积meta分析和图形化结果。

4. metap

metap通过使用Fisher方法,Edgington递增法,或Edgington正态曲线法来合并p值。它是1999年发布的作为6版本的命令(没有图形),最新是在2000年更新的。它需要用户为每个研究输入p值。

5. metareg

metareg执行meta回归。它第一版是在1998年发布的,已经考虑到在Stata估计工具和最近方法开发方面的改进并作了更新。它需要用户为每个研究输入治疗效应估计值和它的标准误。

6. metafunnel

metafunnel生成漏斗图(metafunnel).它是在2004年发布的,使用Stata 8图形。它需要用户为每个研究输入治疗效应估计值和它的标准误。

7. confunnel

confunnel生成contour-enhanced漏斗图。这个命令被设计的非常灵活,允许用户增加额外的特征用于漏斗图。

8. metabias

metabias用于漏斗图不对称的统计检验。第一版于1997年发布,但它已经被更新过以提供最新的proposed检验,以保持对假阳性率(false-positive rate)有比原始命令更好的控制。

9. metatrim

metatrim采用“trim and fill”方法来修正在漏斗图中的发表偏倚(publication bias).它需要用户为每个研究输入治疗效应估计值和它的标准误。

10. metandi 和 metandiplot

metandi为诊断精确性试验(diagnostic test accuracy studies)的meta分析拟合分层logistic回归模型。metandiplot产生由metadi拟合的模型的图形,这必须作为最后的估计类命令执行。

11. glst

glst使用广义最小二乘法(generalized least squares)为单个或多个汇总剂量-反应(dose–response)流行病学研究的趋势估计来计算对数-线性剂量-反应回归模型。从这个命令中得到的输出可能对于从此类研究的meta分析中得出内在的总结效应和他们的标准误来说是有帮助的。

12. metamiss

metamiss执行研究结果有缺失值的二元输出的meta分析。

13. mvmeta 和 mvmeta_make

mvmeta执行随机效应多变量meta分析模型的极大似然,受限极大似然或矩量法(method-of-moments)估计。mvmeta_make帮助从更详细的数据中准备汇总数据集。

下列命令记录在附录中:

14. metannt

metannt通过呈现绝对意义上的干预效应量(effect sizes)帮助解释二元数据的meta分析,比如每千人中需治疗人数(NNT)和事件避免数(或增加数)。用户输入设计参数,metannt使用metan命令来计算需要的统计量。这个命令作为metan包的一部分。

15. metaninf

metaninfmetainf命令的一部分,使用metan作为它的分析引擎而不是meta.它是2001年发布,作为6版本的命令,使用6版本图形,最后更新为2004年。它需要用户提供metan需要的格式作为输入。要安装这个包,在Stata中输入ssc install metaninf

16. midas

midas在Stata中为处理诊断检验性能的meta分析提供统计和图形工作。要安装这个包,在Stata中输入ssc install midas

17. meta_lr

meta_lr画出诊断检验中的正或负似然率。它不能执行单独估计的分层meta分析。用户必须提供效应估计(对数正似然率和对数负似然率)和它们的标准误。metametareg命令用于内部计算。这是8版本的命令,在2004年发布。要安装这个包,在Stata中输入ssc install meta_lr

18. metaparm

metaparm为以parmest格式保存的数据的不同亚组的参数间差异或比率执行meta分析和计算置信区间和p值。要安装这个包,在Stata中输入ssc install metaparm

下列命令出现在Meta-Analysis in Stata: An Updated Collection from the Stata Journal发布后的Stata杂志中。

19. metaan

metaan执行效应估计和标准误的meta分析。Included are profile likelihood and permutation estimation, two algorithms not available in metan.

参考

Deeks, J. J., D. G. Altman, and M. J. Bradburn. 2001.
Statistical methods for examining heterogeneity and combining results from several studies in meta-analysis. In Systematic Reviews in Health Care: Meta-Analysis in Context, 2nd Edition, ed. M. Egger, G. Davey Smith, and D. G. Altman. London: BMJ.

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